Ученые обнаружили 27 генов, которые могут остановить развитие рака

Из анализа более 2000 опухолей, охватывающих 12 видов рака человека, ученые определили 27 новых генов, которые могли бы остановить заболевание на его пути.

Обнаружение этих генов может открыть дверь для столь необходимых персонализированных методов лечения рака, говорят исследователи.

Первый автор исследования Джонас Демелемайстер из Института Фрэнсиса Крика в Соединенном Королевстве и его коллеги недавно сообщили о своих выводах в журнале Nature Communications.

Рак возникает, когда клетки растут и делятся неуправляемое, образуя опухоли.

Человеческие клетки обычно содержат две копии генов-супрессоров опухолей, которые работают для предотвращения образования опухолей за счет замедления деления клеток и их роста. Когда эти гены удаляются, например, посредством генетических мутаций, это приводит к развитию рака.

Как правило, для образования опухолей обе копии генов-супрессоров опухолей должны быть неисправными в клетке. Это связано с тем, что один функционирующий ген супрессора опухолей может все же продуцировать белки, необходимые для замедления деления клеток и их роста.

Но исследователи отмечают, что выявление этих двойных аномалий является сложной задачей. Одна из проблем заключается в том, что опухоли часто содержат смесь здоровых и раковых клеток в различных пропорциях, что затрудняет определение того, отсутствуют ли в раковых клетках один или два гена-супрессора опухолей.

Исследователи создали статистическую модель, которая использует анализ единственного нуклеотидного полиморфизма, который мог бы помочь в решении таких проблем. До сих пор он помогал им идентифицировать множество новых генов-супрессоров опухолей.

«Мощный способ поиска новых генов рака»

Исследователи использовали свою модель для оценки количества генов-супрессоров опухолей в клетках из 2218 опухолей по 12 типам рака. К ним относятся рак молочной железы, рак легких, колоректального рака, рака яичников и головного мозга.

Модель не только позволила команде рассчитать относительные пропорции здоровых и раковых клеток в каждой опухоли, что облегчает определение наличия генов-супрессоров опухолей в клетках, но также выявляет отчетливый «след ДНК» генов-супрессоров опухолей , Это позволило им отличить эти гены от вредоносных мутаций гена.

В результате исследователи идентифицировали в общей сложности 96 генных делеций среди опухолей. Они включали 43 опухолевых супрессорных гена, из которых 27 ранее были неизвестны.

«Наше исследование демонстрирует, — объясняет старший автор исследования Питер Ван Ло, член Института Фрэнсиса Крика, — что редкие гены-супрессоры опухолей можно идентифицировать посредством крупномасштабного анализа количества генных копий в образцах рака».

«Рак генома — это растущая область исследований, а используемые нами вычислительные средства — это мощный способ поиска новых генов, участвующих в раке», — добавляет он.

Выводы могут стимулировать персонализированное лечение

Рак остается одним из самых больших бременем в мире. В 2012 году в мире появилось около 14,1 млн. новых случаев рака, диагностированных по всему миру, причем среди них наиболее распространены рак легких, рак молочной железы и колоректальный рак.

В Соединенных Штатах в прошлом году было диагностировано более 1,6 миллиона новых случаев рака, и из этой болезни умерло более 595 000 человек.

Согласно Demeulemeester и его исследованиям , их результаты могут привести к персонализированной терапии рака — то есть, индивидуально подобранное лечение, которое подбирается на основе генетического состава их опухолей.

«Используя этот мощный инструментарий, у нас есть надежда проложить путь для развития персонализированных онкологических методов».